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Méthodes MO

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Fichier d'entrée MOPAC pour l'optimisation structurelle de l'éthanol

Après les mots clés nécessaires (voir pages suivantes), qui précisent le type de calcul et la sortie, un texte peut éventuellement être saisi. Viennent ensuite les données structurelles de la molécule à calculer, sous la forme d'une matrice Z des coordonnées dites internes. Chaque atome est caractérisé par son symbole ou son numéro atomique, une distance de liaison, un angle de liaison et un angle de torsion aux atomes déjà décrits ; le triple des centres de référence est répertorié pour chaque atome. Pour les trois premiers centres, il existe une entrée spéciale qui définit la structure par rapport au système de coordonnées. Pour chacun des (3N-6) degrés de liberté structurels, vous pouvez spécifier comment ce degré de liberté (optimisé, enregistré ou traité comme une coordonnée de réaction).

Exemple d'entrée éthanol

Le fichier d'entrée suit (pour l'orientation, voir la figure ci-dessus) :

COMPOSÉ DE FORCE DE VECTEURS PRÉCIS PM3 : Éthanol PM3-Hamiltonian CC 1.5 1 O 1.3 1 109 1 H 1.1 1 109 1 180 1 1 2 3 H 1.1 1109 1 300 1 1 2 3 H 1.1 1 109 1 60 1 2 1 4 H 1.1 1 109 1 300 1 1 2 6 H 1,1 1 109 1 180 1 2 1 7 H 0,9 1 109 1 180 1 32 1 0 0 0

Les mots-clés ont les significations suivantes :

  • PM3 - Hamiltonien en approximation PM3
  • PRÉCIS - les calculs sont effectués avec une précision accrue
  • VECTEURS - les vecteurs propres (c'est-à-dire les MO) sont répertoriés
  • FORCE - après avoir calculé la Force Constant Matrix (dérivées secondes), une analyse vibratoire suit : matrice FG, diagonalisation, résultant en des valeurs propres et des vecteurs propres (modes normaux) des vibrations moléculaires.


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Commentaires:

  1. Nezil

    Exactement! C'est l'excellente idée. Je le garde.

  2. Domevlo

    À mon avis, vous avez tort. Envoyez-moi un courriel à PM, nous en discuterons.

  3. Egidius

    la phrase magnifique et c'est opportun

  4. Adair

    Entre nous, je ne ferais pas ça.

  5. Darel

    Je m'excuse, mais pourriez-vous donner plus d'informations.

  6. Tezragore

    Ce n'est déjà de loin aucune exception



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