Chimie

Prédictions de structure dans les protéines

Prédictions de structure dans les protéines


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La liaison peptidique est plane

L'unité répétitive dans un peptide est représentée par un atome de carbone (αje) à l'atome de carbone suivant (αje + 1) Sont définis. En raison de la mésomérie du groupe carboxamide, le C est situé??-, CO, N et H atomes presque dans un plan. La figure suivante montre les orbitales impliquées dans la liaison peptidique.

La rotation de ce plan contre le plan du reste est décrite par convention par deux angles de torsion (voir fig. 2). L'angle de torsion correspond à une rotation autour du HC??-NH liaison et l'angle de torsion pour une rotation autour du C??-Liaison CO. Une rotation dans le plan est décrite par un troisième angle . En première approximation, cependant, = 180 °, c'est-à-dire le C??-La liaison CO est trans au prochain C??-N liaison. En d'autres termes, le plan de l'unité peptidique est plan.

Noter
La loi fondamentale de la structure des protéines dit : Le plan de la liaison peptidique est planaire.


Vidéo: Prédiction de la structure 3D dune protéine avec loutil SWISS-MODEL (Juin 2022).