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Classification systématique des virus

En 1971, le prix Nobel David Baltimore a suggéré que les virus soient classés sur la base de leur stratégie de réplication et donc selon le type d'acide nucléique. Selon cette classification, les virus sont identifiés avec un ADN ou un ARN simple brin (ssDNA ou ssRNA, ss pour simple brin) et ADN ou ARN double brin (dsDNA ou dsRNA, ds pour double brin) différenciée. Un acide nucléique simple brin peut avoir deux directions. l'ADN dirigé de manière correspondante est ici par définition appelé ARN (+) et ADN (+), ARN ou ADN complémentaire à l'ARNm sous forme d'ARN (-) ou d'ADN (-).

La classification de Baltimore n'est désormais utilisée que dans quelques domaines de recherche, car elle conduit à des regroupements parfois déroutants : le bactériophage T2 et les virus varioliques sont dans le même groupe sans même être apparentés en termes évolutifs. La taxonomie des virus courante aujourd'hui est basée sur les décisions d'un organisme international, le Comité international de taxonomie des virus (ICTV). Base de données universelle sur les virus de l'ICTV à l'Institut national de la santé des États-Unis

Étant donné que le mode de réplication est plus important que les relations évolutives pour la pratique de la biologie moléculaire, il est logique dans le contexte de cette unité d'apprentissage de regrouper les virus en fonction de leur organisation génomique comme suit.

Classification des virus basée sur le génome

  • ADN double brin (dsDNA) comme dans les virus de l'adéno, de l'herpès ou de la variole.
  • ADN simple brin (ADNsb).
  • ARN double brin (ARNdb) comme dans les Reo- ou Birnavirus.
  • ARN simple brin dirigé positivement (ARN ss (+)) comme dans les picorna, les toga, les calici, les flavirus et les coronavirus.
  • ARN monocaténaire dirigé négativement (ARN ss (-)) comme dans Orthomyxo, Rhabdo, Paramyxo, Filo, Bunya ou Bornavia.
  • ARN simple brin dirigé positivement avec une étape intermédiaire d'ADN, comme dans les rétrovirus.
  • ADN double brin avec une étape d'ARN intermédiaire, comme dans le cas des virus Hepadna.