Chimie

Modélisation des protéines (hélice)

Modélisation des protéines (hélice)


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4. Modélisation de l'exemple de séquence sur une structure protéique avec une homologie de séquence élevée :

Fig. 1
Représentation -hélicoïdale

Tout d'abord, la séquence de la protéine inconnue est chargée sous forme de fichier texte. Le programme génère automatiquement une hélice à partir de cela.

Figure 2
Structures protéiques

Ensuite, les structures protéiques connues (une seule dans l'exemple) sont chargées.

Figure 3
Structures protéiques

La séquence est superposée à la protéine au moyen d'une routine d'adaptation. Les séquences superposées peuvent toujours être décalées les unes par rapport aux autres dans une fenêtre d'alignement. Ce modèle des données brutes est maintenant envoyé dans un e-mail au serveur de modélisation EMBL à Heidelberg.

Figure 4
Structures protéiques

La proposition de serveur de messagerie EMBL est illustrée dans (Fig. 3) et (Fig. 4). On peut clairement voir les zones hélicoïdales, qui sont maintenant interrompues par des zones de tour β et transforment la protéine en forme de bâtonnet en une protéine globulaire.



Commentaires:

  1. Bramley

    Je le comprends bien. Je peux aider à la décision de question. Ensemble, nous pouvons trouver la décision.

  2. Palsmedes

    Bravo, quelle est la bonne phrase... super idée

  3. Bradwell

    C'est agréable, cette excellente pensée doit être précisément exprès

  4. Vilkree

    Cette variante ne me convient pas.

  5. Fenrinos

    Je pense que vous n'avez pas raison. Écrivez-moi dans PM, nous en discuterons.

  6. Winston

    Bravo, réponse parfaite.



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