Chimie

Prédictions de structure dans les protéines

Prédictions de structure dans les protéines


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La recherche de zones de feuille β

La formation d'un germe de foliole et l'expansion de la foliole doivent obéir à cinq critères. Aucun de ces critères n'est vraiment strict, mais ils donnent un bon guide des lois.

1. Création de dossier

Vous commencez par les trois premiers résidus d'acides aminés et vérifiez s'ils appartiennent tous au domaine des constructeurs d'hélices Hb ou hb. Alternativement, trois résidus sur quatre ou cinq peuvent obéir à ce critère. Cette séquence est considérée comme la graine d'un feuillet .

2. Extension de dossier

Le germe est allongé d'un résidu dans les deux sens tant que le tétrapeptide suivant ne contient aucun casseur de feuille β. Il est au moins défavorable si l'élément entier est constitué de plus d'un tiers de casse-feuilles ou de moins de la moitié seulement de formeurs de feuilles .

3. Crash de dossier

Les mêmes règles s'appliquent ici que pour la limitation de l'hélice. Seules les valeurs correspondantes de la zone du dépliant doivent être utilisées. S'il existe des valeurs moyennes d'hélice plus élevées pour une région, la formation de la feuille est annulée.

4. Brise-doseurs puissants

L'acide glutamique (Glu, E) et la proline (Pro, P) sont les casse-feuilles β les plus puissants. Ils ne doivent pas être incorporés dans des notices sauf qu'ils sont dans un tétrapeptide pour lequel la valeur moyenne [P??] plus petit que [P??] mais est supérieur à 1,00.

5. Limites des dossiers

Les résidus d'acides aminés chargés et la proline sont défavorables à l'extension du feuillet. Seulement si la valeur moyenne [P??] plus petit que [P??], mais est supérieur à 1,00, le dépliant peut être allongé.

Littérature

Kyte, J.; Doolittle, R. F. (1982):Une méthode simple pour afficher le caractère hydropathique d'une protéine. Dans: J. Mol. Biol.. 157, 105-132


Vidéo: Easy English 29 - Talking about the future (Juin 2022).


Commentaires:

  1. Moogusida

    Je peux vous conseiller à ce sujet. Ensemble, nous pouvons arriver à la bonne réponse.

  2. Kigatilar

    Il y a quelque chose. Merci pour une explication. Je ne le savais pas.

  3. Ine

    Quels mots...

  4. Kevinn

    Vraiment intéressant, merci

  5. Rodger

    Je partage complètement votre opinion. Il y a aussi quelque chose pour moi, il me semble que c'est une très bonne idée. Complètement avec vous, je serai d'accord.

  6. Taugar

    que ce n'est pas vrai.



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